Ubuntu Desktop 18.04にFolding@Homeをインストールする！
Folding@homeの新型コロナウイルス タンパク質構造解析プロジェクトに参加するため、Folding@Homeのソフトウェアをインストールします。
記事の目次
使用した環境
- Intel® Core™ i5-7500
- GeForce GTX 1050 Ti
- Ubuntu 18.04 LTS Desktop (18.04.3)
- CUDA 10.2
- FAHClient 7.5.1
- FAHControl 7.5.1
- FAHViewer 7.5.1
CUDA 10.2のインストール
CUDA 10.2をインストールしていない場合は、以下の記事を参考にインストールします。
Folding@Homeのパッケージのダウンロード
Folding@Homeのパッケージを「Start Folding」から「Debian / Mint / Ubuntu」用の以下のモジュールをダウンロードします。
- fahclient_7.5.1_amd64.deb
- fahcontrol_7.5.1-1_all.deb
- fahviewer_7.5.1_amd64.deb
FAHClientのインストールの実行
以下のコマンドを実行して、FAHClientをインストールします。
$ cd $HOME/Downloads $ ls -1 fah* fahclient_7.5.1_amd64.deb fahcontrol_7.5.1-1_all.deb fahviewer_7.5.1_amd64.deb $ sudo dpkg -i --force-depends fahclient_7.5.1_amd64.deb Selecting previously unselected package fahclient. (Reading database ... 136544 files and directories currently installed.) Preparing to unpack fahclient_7.5.1_amd64.deb ... usermod: no changes Unpacking fahclient (7.5.1) ... Setting up fahclient (7.5.1) ... The Folding@home client is now installed You can access the Web interface by going to: https://client.foldingathome.org/ in a browser on this computer. For information about configuring the Folding@home client for remote access please see the comments in: /etc/fahclient/config.xml Processing triggers for ureadahead (0.100.0-21) ... Processing triggers for systemd (237-3ubuntu10.24) ... Processing triggers for gnome-menus (3.13.3-11ubuntu1.1) ... Processing triggers for desktop-file-utils (0.23-1ubuntu3.18.04.2) ... Processing triggers for mime-support (3.60ubuntu1) ...
インストールの過程で、初期設定として、以下入力します。
- Folding@Home User Name・・・任意の名前
- Folding@Home Team Number・・・0
- Folding@Home Passkey・・・※入力なし
- Configuring fahlient（リソース）・・・medium
- Configuring fahlient（自動起動）・・・yes
fahclientはサービスとして自動で起動します。※インストール直後から動作します。
FAHControlのインストールを実行
以下のコマンドを実行して、FAHControlをインストールします。
$ cd $HOME/Downloads $ ls -1 fah* fahclient_7.5.1_amd64.deb fahcontrol_7.5.1-1_all.deb fahviewer_7.5.1_amd64.deb $ sudo dpkg -i --force-depends fahcontrol_7.5.1-1_all.deb (Reading database ... 136556 files and directories currently installed.) Preparing to unpack fahcontrol_7.5.1-1_all.deb ... Unpacking fahcontrol (7.5.1-1) over (7.5.1-1) ... dpkg: fahcontrol: dependency problems, but configuring anyway as you requested: fahcontrol depends on python-gnome2; however: Package python-gnome2 is not installed. fahcontrol depends on python-support | dh-python; however: Package python-support is not installed. Package dh-python is not installed. Setting up fahcontrol (7.5.1-1) ... Processing triggers for gnome-menus (3.13.3-11ubuntu1.1) ... Processing triggers for desktop-file-utils (0.23-1ubuntu3.18.04.2) ... Processing triggers for mime-support (3.60ubuntu1) ...
この状態で、FAHControlコマンドを実行しても以下のエラーで動作しません。
$ FAHControl bash: /usr/bin/FAHControl: /usr/bin/python: bad interpreter: No such file or directory
以下のコマンドで、パッケージの依存関係の問題を解消します。
$ sudo apt --fix-broken install
起動は、Activityから「FAHControl」と入力して起動するか、以下のコマンドを実行します。
$ FAHControl
すると、以下のような画面が表示され、FAHが動作していることがわかります。※しばらく待つと、Work Unitがダウンロードされ実行が開始されます。
FAHViewerのインストールを実行
以下のコマンドを実行して、FAHViewerをインストールします。
$ cd $HOME/Downloads $ ls -1 fah* fahclient_7.5.1_amd64.deb fahcontrol_7.5.1-1_all.deb fahviewer_7.5.1_amd64.deb $ sudo dpkg -i --force-depends fahviewer_7.5.1_amd64.deb Selecting previously unselected package fahviewer. (Reading database ... 136556 files and directories currently installed.) Preparing to unpack fahviewer_7.5.1_amd64.deb ... Unpacking fahviewer (7.5.1) ... Setting up fahviewer (7.5.1) ... Processing triggers for gnome-menus (3.13.3-11ubuntu1.1) ... Processing triggers for desktop-file-utils (0.23-1ubuntu3.18.04.2) ... Processing triggers for mime-support (3.60ubuntu1) ...
起動は、Activityから「FAHViewer」と入力して起動するか、以下のコマンドを実行します。
$ FAHViewer
以下のような画面が表示され、タンパク質構造解析に貢献できている感覚が伝わってきます。
FAHClientの起動と停止
サービスとして動作するFAHClientの起動と停止方法です。
FAHClientの起動
FAHClientの起動方法です。
$ sudo /etc/init.d/FAHClient start
FAHClientの停止
FAHClientの停止方法です。
$ sudo /etc/init.d/FAHClient stop
FAHClient自動起動時のWork Unitの開始を一時停止
AHControlの上部のパネルにあるConfigureをクリックし設定画面を表示後、Expertタブを選択し、Nameを「pause-on-start」、Valueを「true」の組み合わせを「add」し、設定を「Save」します。開始は、FAHControlから「Fold」をクリックします。
FAHClientのアンインストール
サービスとして動作するFAHClientのアンインストール方法です。設定誤りで起動しなくなった場合に、再インストールするために使用することもあります。
$ sudo dpkg -P fahclient
疾病の選択
FAHControlの上部のパネルにあるConfigureをクリックし設定画面を表示後、Advancedタブを選択し、「Cause Preference」の項目で疾病を選択します。新コロナウィルスのプロジェクトに参加するためには、デフォルトの「Any」にします。
おわりに
Folding@Homeのソフトウェアのインストールと起動確認を行いました。FAHControlのインストールについては依存パッケージの問題で素直には行きませんが、aptの修復コマンドで対応可能でした。
次の記事
本稿では、CPUでWork Unitを実行しています。字義の記事では、GPUを使用するように設定します。
参考情報
関連記事
